Assemblage d'ADN avec graphes de de Bruijn sur FPGA

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dc.contributor.advisorFortier, Paul-
dc.contributor.advisorGosselin, Benoit-
dc.contributor.authorPoirier, Carl-
dc.date.accessioned2018-04-24T21:14:18Z-
dc.date.available2018-04-24T21:14:18Z-
dc.date.issued2015-
dc.identifier.other32442-
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11794/27132-
dc.description.abstractCe mémoire est consacré à la parallélisation d'un algorithme d'assemblage d'ADN de type de novo sur différentes plateformes matérielles, soit les processeurs multicoeurs et les accélérateurs de type FPGA. Plus précisément, le langage OpenCL est utilisé pour accélérer l'algorithme dont il est question, et de permettre un comparatif direct entre les les plateformes. Cet algorithme est d'abord introduit, puis son implémentation originale, développée pour une exécution sur une grappe de noeuds, est discutée. Les modifications apportées à l'algorithme dans le but de faciliter la parallélisation sont ensuite divulgées. Ensuite, le coeur du travail est présenté, soit la programmation utilisant OpenCL. Finalement, les résultats sont présentés et discutés.fr_CA
dc.format.extent1 ressource en ligne (xiii, 57 pages)-
dc.languagefre-
dc.subject.classificationTK 7.5 UL 2015-
dc.titleAssemblage d'ADN avec graphes de de Bruijn sur FPGAfr_CA
dc.typeCOAR1_1::Texte::Thèse::Mémoire de maîtrisefr
dc.date.updated2018-04-24T21:14:18Z-
dc.subject.rvmRéseaux logiques programmables par l'utilisateurfr_CA
dc.subject.rvmCompilateurs parallèlesfr_CA
dc.subject.rvmAssemblage (Informatique)fr_CA
dc.subject.rvmAlgorithmesfr_CA
dc.subject.rvmADNfr_CA
dcterms.publisher.locationQuébec-
dc.identifier.bacTC-QQLA-32442-
bul.identifier.controlNumbera2598177-
etdms.degree.nameMémoire. Génie électriquefr_CA
etdms.degree.grantorUniversité Lavalfr_CA
Collection:Thèses et mémoires

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