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Personne :
Varin, Thibaut

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Nom de famille

Varin

Prénom

Thibaut

Affiliation

Université Laval. Département de médecine moléculaire

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Identifiant Canadiana

ncf11863760

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Résultats de recherche

Voici les éléments 1 - 5 sur 5
  • PublicationAccès libre
    El caso Seralini y la confianza en el orden normativo dominante de la ciencia
    (UAM-A. División de Ciencias Sociales y Humanidades. Departamento de Sociología., 2015-12-01) Piron, Florence; Varin, Thibaut
    ¿De dónde viene la confianza en la ciencia?; ¿cómo se nutre y se refuerza? En un contexto en el que, bajo el pretexto de la crisis en las finanzas públicas, las políticas científicas nacionales parecen favorecer el camino del financiamiento de la ciencia a través de asociaciones con el sector privado, en particular con las grandes empresas industriales,1 la confianza en la ciencia sigue siendo el argumento principal para justificar el mantenimiento e incluso reforzar el apoyo gubernamental a la investigación. El tema de la confianza parece, así pues, ser fundamentalmente político y no sólo ético: una ciencia que inspira confianza en los ciudadanos-contribuyentes podrá justificar su financiamiento con fondos públicos, a través de la riqueza colectiva.
  • PublicationAccès libre
    Raspberry consumption : identification of distinct immune-metabolic response profiles by whole blood transcriptome profiling
    (Elsevier, 2022-01-10) Franck, Maximilien; Toro Martin, Juan de; Varin, Thibaut; Garneau, Véronique; Pilon, Geneviève; Roy, Denis; Couture, Patrick; Couillard, Charles; Marette, André; Vohl, Marie-Claude
    Background. Numerous studies reported that diets rich in phenolic compounds are beneficial to human health, especially for immune-metabolic conditions, yet these effects and underlying mechanisms are not well defined. Objectives. The main goal of this study was to investigate the architecture of the inter-individual variability of the immune-metabolic response to raspberry consumption, by identifying distinct subgroups of participants sharing similar transcriptomic signatures. Methods. The 24 participants assigned to the treated arm of a randomized controlled trial, and at risk of developing metabolic syndrome, received 280g/day of frozen raspberries for 8 weeks. RNAseq data from whole blood assessed at weeks 0 and 8 were used to identify sub-groups of responses to raspberry consumption, by using partial least-squares discriminant analysis (PLS-DA) and hierarchical clustering. Changes in clinical features, metabolic parameters, plasma metabolites and gut metagenomics were compared between the resulting sub-groups. Results. Transcriptomic-based clustering regrouped the initial 24 study participants into two significantly different sub-groups of response to raspberry consumption, with 13 participants being defined as responders and 11 as non-responders. Following raspberry consumption, a significant decrease in plasma triglycerides, total-cholesterol and C-reactive protein was found in the responder sub-group, as compared to the non-responder sub-group. Two major components composed respectively of 100 and 220 genes were further identified by sparse PLS-DA as those better discriminating responders and non-responders. Functional pathways related to cytokine production, leukocyte activation and immune response were significantly enriched with discriminant genes. Factor analysis revealed that the first metabolomic factor mostly composed of decreasing triglycerides and increasing phosphatidylcholines was significantly higher in responders, as compared to non-responders. Analysis of gut metagenomic data revealed differences between responders and non-responders prior to the intervention and distinct modulations, notably regarding Firmicutes and Actinobacteria phyla. Conclusions. The discrimination analysis carried out in the present study based on transcriptional changes following raspberry consumption was able to identify two divergent sub-groups of participants, which were further identified as responders and non-responders, according to their immune-metabolic and gut metagenomic responses. In the context of precision nutrition, this holistic approach represents a promising framework to tackle the issue of inter-individual variability in the understanding of the impact of foods or nutrients on immune-metabolic health.
  • PublicationAccès libre
    Métagénomique des tapis microbiens polaires
    (2013) Varin, Thibaut; Lovejoy, Connie; Corbeil, Jacques
    Le domaine de l'écologie microbienne est en pleine effervescence grâce à l'avènement de la métagénomique et des techniques de séquençage de nouvelle génération (SNG), qui nous apportent une meilleure compréhension de la structure et du fonctionnement des communautés microbiennes de la biosphère. Cette thèse illustre ainsi une manière de tirer profit de l'utilisation de ces nouvelles technologies, dans le but d'étudier un écosystème qui a été très peu caractérisé jusqu'à maintenant, en l'occurrence les tapis microbiens polaires. Les analyses métagénomiques de différents tapis microbiens polaires ont permis dans un premier temps, de dresser une description générale de la taxonomie et du potentiel fonctionnel des communautés microbiennes en question, pour ensuite nous permettre d'examiner de façon plus exhaustive deux de leurs particularités métaboliques. L'existence éventuelle d'un système de recyclage des nutriments au sein même des tapis microbiens étudiés a été soulevée étant donné le caractère oligotrophique de leur milieu environnant. L'analyse des profils métagénomiques des tapis microbiens de l'Arctique a permis de mettre en évidence plusieurs groupes de gènes impliqués dans des mécanismes de décomposition et de récupération qui donneraient la possibilité à ces communautés de retenir et de recycler leurs nutriments au sein de leur microenvironnement benthique. Un autre aspect des tapis microbiens polaires sur lequel je me suis penché lors de ce doctorat, concerne la propension des membres peuplant ce type d'écosystème à s'acclimater à un large panel de stress découlant de la nature extrême de leur habitat. La présence de divers procédés métaboliques d'adaptation au froid et à d'autres stress a été observée à partir de l'analyse du métagénome des ces communautés arctiques et antarctiques, en concordance avec les différents niveaux de représentation des principaux groupes bactériens. Cette thèse démontre à quel point le recours aux disciplines « méta-omiques », peut nous amener vers une meilleure compréhension de l'écologie microbienne, et comment l'émergence de ces technologies a permis d'aborder différemment des thèmes aussi fondamentaux que celui de la biogéographie des microorganismes.
  • PublicationAccès libre
    Feeding diversified protein sources exacerbates hepatic insulin resistance via increased gut microbial branched-chain fatty acids and mTORC1 signaling in obese mice
    (Nature Publishing Group, 2021-06-07) Marcotte, Bruno; Houde, Vanessa; Daniel, Noémie; Marette, André; Tremblay, Angelo; Varin, Thibaut; Vors, Cécile; Choi, Béatrice; Ouellette, Adia; Ilkayeva, Olga; Feutry, Perrine; Ståhlman, Marcus; St-Pierre, Philippe; Bäckhed, Fredrik; Phillip J. White
    Animal models of human diseases are classically fed purified diets that contain casein as the unique protein source. We show that provision of a mixed protein source mirroring that found in the western diet exacerbates diet-induced obesity and insulin resistance by potentiating hepatic mTORC1/S6K1 signaling as compared to casein alone. These effects involve alterations in gut microbiota as shown by fecal microbiota transplantation studies. The detrimental impact of the mixed protein source is also linked with early changes in microbial production of branched-chain fatty acids (BCFA) and elevated plasma and hepatic acylcarnitines, indicative of aberrant mitochondrial fatty acid oxidation. We further show that the BCFA, isobutyric and isovaleric acid, increase glucose production and activate mTORC1/ S6K1 in hepatocytes. Our findings demonstrate that alteration of dietary protein source exerts a rapid and robust impact on gut microbiota and BCFA with significant consequences for the development of obesity and insulin resistance.
  • PublicationAccès libre
    L'affaire Séralini et la confiance dans l'ordre normatif dominant de la science
    (Implications philosophiques, 2014-07-04) Piron, Florence; Varin, Thibaut
    D’où vient la confiance dans la science ? Comment est-elle nourrie et renforcée? Dans un contexte où, au prétexte de la crise des finances publiques, les politiques scientifiques nationales semblent privilégier la voie du financement de la science par des partenariats avec le secteur privé, notamment la grande industrie, la confiance dans la science reste un argument majeur pour justifier le maintien ou même le renforcement du soutien de l’État à la recherche scientifique. L’enjeu de la confiance dans la science apparaît ainsi fondamentalement politique et non pas seulement éthique : une science inspirant confiance aux citoyens/contribuables pourra justifier son financement par les fonds publics, par la richesse collective.